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Prepare Datasets for P²SAM

Download the NSCLC-Radiomics, 4D-Lung, Kvasir-SEG, CVC-ClinicDB, and PerSeg datasets. Organize them as follows:

NSCLC Datasets

Raw Data

data
├── lung_org/
│  ├── NSCLC-Radiomics/
│  │  ├── LUNG1-001/
│  │  ├── .../
│  │  └── LUNG1-422/
│  └── 4D-Lung
│     ├── 100_HM10395/
│     ├── .../
│     └── 119_HM10395/

Processed Data (lung.ipynb)

data
├── lung_pro/
│  ├── nsclc_radiomics/
│  │  ├── image/ LUNG*/ *.png
│  │  └── label/ LUNG*/ *.png
│  └── 4d_lung_multi_visits/
│     ├── image/ *_HM10395/ *.png
│     └── label/ *_HM10395/ *.png

Endoscopy Datasets

Raw Data

data
├── endoscopy_org/
│  ├── Kvasir-SEG/
│  │  ├── images/ *.jpg
│  │  └── masks/ *.jpg
│  └──CVC-ClinicDB
│     ├── Ground Truth/ *.tif
│     └── Original/ *.tif

Processed Data (endoscopy.ipynb)

data
├── endoscopy_pro/
│  ├── kvasir_seg/
│  │  ├── image/ *.png
│  │  └── label/ *.png
│  └── cvc_clinicdb/
│     ├── image/ video*/ *.png
│     └── label/ video*/ *.png

PerSeg

data/
├── perseg/
│   ├── Annotations/ objects/ *.png
│   └── Images/ objects/ *.jpg